Es un método poco utilizado, se utiliza para cuantificar (osea expresar numéricamente una magnitud) el numero de copias de ADN en una escala genómica (para una facilidad de representación).
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Son secuencias de locus (es una posición fija sobre un cromosoma de ADN específicos de todo el genoma que son aislada y enumeradas. este método es también conocido como cariotipado virtual.